<<
>>

Взаимодействие лабораторий ЛПМО и научных лабораторий, выполняющих функции референсных центров.

Учитывая технические и методические возможности, имеющиеся в лабораториях Л11МО и научных организаций, представляется целесообразным дифференциация видов исследований на различных уровнях (этапах) проведения молекулярно-генетического мониторинга.

На первом этапе в рамках рутинного микробиологического мониторинга (мониторинга антибиотикорезистентности), проводимого в ЛПМО, отбираются штаммы, имеющие идентичный или сходный профиль внутривидового типирования, проведенного с использованием методов, доступных лаборатории ЛПМО (антибиотикотипирование, фаготипирование и т.п.). Затем данные штаммы подвергаются генетическому 34

типированию доступными методами, основанными на ПЦР (MLVA, RAPD). Штаммы, отнесенные к одной и той же клональной линии по результатам генетического типирования с учетом данных эпидемиологического наблюдения в стационаре, могут быть интерпретированы как госпитальные штаммы. Генетическое типирование на данном этапе могут выполнять как лаборатории стационаров, использующие в своей практике метод ПЦР, так и лаборатории, выполняющие функции региональных центров по мониторингу за возбудителями внутрибольничных инфекций (референс-лаборатории). Следующий этап предполагает типирование репрезентативных выборок из наиболее распространенных в стационарах региона госпитальных штаммов методами основанными на секвенировании-типировании (spa-сиквенстипирование, MLVA), методом PFGE или иными методами с высокой дискриминирующей способностью. В результате, региональные и национальные референс-лаборатории получают возможность осуществлять слежение за динамикой распространения в регионе штаммов, отнесенных к международным клональным линям (эпидемическим или пандемическим клонам).

Таким образом, локальный молекулярно-генетический мониторинг включает идентификацию госпитальных штаммов методами, основанными на ПЦР(MLVA, RAPD). Молекулярно-генетический мониторинг, осуществляемый на региональном и национальном (глобальном) уровнях, должен быть направлен на идентификацию эпидемических клонов, анализ их происхождения и связи с другими географическими регионами с использованием международных баз данных.

Передача микроорганизмов в референс - лабораторию должна осуществляться при наличии показаний к молекулярно-генетическому типированию, представленных в п.8.1. При необходимости длительного хранения культур от момента выделения до отправки в референс - лабораторию выделенные микроорганизмы следует хранить в лаборатории ЛПМО в пробирках со средой для хранения (например триптазо-соевом бульоне с добавлением 15% глицерина) при температуре -18 - 20 ° С (в морозильной камере

холодильника). Допустимо также хранение культур в столбиках полужидкого агара при температуре +4 - +7 ° С.

Лаборатории ЛПМО предоставляют культуры в пробирках в столбиках полужидкого агара или используют для передачи культур транспортные системы с транспортной средой (например, со средой Стюарта).

Информация о передаваемых культурах

Каждая культура должна сопровождаться направлением, содержащим информацию о больном, сведения о характере гнойно-септической инфекции, обусловленной

выделенным микроорганизмом, о предполагаемых факторах риска колонизации данным микроорганизмом.

Информация о пациентах является конфиденциальной и поэтому, в графе ФИО приводятся только инициалы пациента, которые будут зашифрованы в процессе дальнейшей обработки данных.

Далее указываются наименование учреждения и лаборатории, ФИО лица, направившего культуру, номер культуры по журналу и дата ее отправки в референс- лабораторию.

Образец карты сбора информации на культуру микроорганизма, передаваемую в референсную лабораторию приведен в приложении 2.

Референсная лаборатория предоставляет заинтересованным сторонам заключение по результатам проведенных исследований, в котором должна быть представлена следующая информация:

- количество изученных полученных культур микроорганизмов;

- краткое описание используемой методики генотипирования с указанием используемого оборудования и программного обеспечения, при использовании метода прямого секвенирования — размеров и расположения анализируемых участков генома;

- при использовании методик, результаты которых имеют форму паттернов (фингерпринтов) (MLVA, PFGE) — графическое представление полученных результатов в виде электрофореграммы и дендрограммы (филогенетического дерева), полученной в результате анализа паттернов типирования.

10.

<< | >>
Источник: Молекулярно-генетический мониторинг в системе эпидемиологического надзора за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи. Федеральные клинические рекомендации - М.,2014. - 45 с.. 2014

Еще по теме Взаимодействие лабораторий ЛПМО и научных лабораторий, выполняющих функции референсных центров.:

  1. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ МОНИТОРИНГ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ИСМП, ПРОВОДИМЫЙ В ЛАБОРАТОРИЯХ, ВЫПОЛНЯЮЩИХ ФУНКЦИИ РЕФЕРЕНСНЫХ.
  2. Организация работы микробиологической лаборатории
  3. Почему тест на коронавирус могут провести только специализированные лаборатории? Почему для теста на коронавирус нельзя взять пробу на дому?
  4. Роль Дальневосточного окружного Центра Минздрава России но профи­лактике и борьбе со СПИДом в осуществлении научно-методической профи­лактической работы.
  5. СТАНОВЛЕНИЕ НАУЧНОЙ КЛИНИЧЕСКОЙ МЕДИЦИНЫ. НАУЧНЫЕ КЛИНИЧЕСКИЕ ШКОЛЫ В ОТЕЧЕСТВЕННОЙ ХИРУРГИИ И ПЕДИАТРИИ, НЕВРОЛОГИИ И ПСИХИАТРИИ: вторая половина 19-го века
  6. Общие требования к организации микробиологического мониторинга чувствительности/устойчивости микроорганизмов, циркулирующих в ЛПМО.
  7. РЕЗУЛЬТАТЫ НАБЛЮДЕНИЯ ЗА ПАЦИЕНТАМИ С БРОНХОЭКТАТИЧЕСКОЙ БОЛЕЗНЬЮ ПО ДАННЫМ ПУЛЬМОНОЛОГИЧЕСКОГО ЦЕНТРА Г. ВЕЛИКИЙ НОВГОРОД
  8. ГЕНЕТИЧЕСКИЕ И НЕГЕНЕТИЧЕСКИЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ МЕЖДУ ВИРУСАМИ
  9. МИКРОБИОТА ЛЕГКИХ И АНТИБИОТИКОРЕЗИСТЕНТНОСТЬ СИНЕГНОЙНОЙ ПАЛОЧКИ У ДЕТЕЙ ОМСКОГО ЦЕНТРА МУКОВИСЦИДОЗА
  10. Взаимодействие причин
  11. Взаимодействие вируса с клеткой
  12. НАУЧНЫЕ ВИРУСОЛОГИЧЕСКИЕ УЧРЕЖДЕНИЯ В СССР
  13. Меры по защите персонала, непосредственно взаимодействующего с зараженными COVID-19
  14. § 2.2. Взаимодействие государственных учреждений и общественных организаций в области медицины земского периода
  15. Индикация специфических взаимодействий моноклональных антител с мононуклеарными клетками крови
  16. Научная новизна
  17. ЭПИДЕМИЧЕСКИЙ ПРОЦЕСС В ЭПОХУ НАУЧНО-ТЕХНИЧЕСКОГО ПРОГРЕССА
  18. Научное обоснование народной медицины